Thèse soutenue publiquement le 03 Juillet 2019 devant le jury composé de : Mme Katy JEANNOT, Maître de conférences, Université de Franche Comté - Rapporteur Mr Bertrand TOUSSAINT, Professeur des Universités, Université Grenoble Alpes - Rapporteur Mme Sylvie CHEVALIER-LAURENCY, Professeur des Universités, Université de Rouen Normandie - Examinateur Mr Damien SEYER, Maître de conférences, Université de Cergy Pontoise - Examinateur Mr Pascal COSETTE, Professeur des Universités, Université de Rouen Normandie - Directeur de thèse Mr Thierry JOUENNE, Directeur de Recherche CNRS, Université de Rouen Normandie - Codirecteur de thèse
Résumé: Pseudomonas aeruginosa (PA) est une bactérie Gram négatif, pathogène opportuniste, impliquée dans un grand nombre d’infections nosocomiales. Cette bactérie est aussi le principal micro-organisme responsable des surinfections broncho-pulmonaires chez les patients atteints de mucoviscidose. Cette prééminence est due en partie à la capacité de PA à former des biofilms, ce qui lui confèrent une résistance exceptionnelle aux antimicrobiens. Au sein de notre laboratoire, une analyse protéomique différentielle a permis de démontrer, en 2004, l’existence d’un protéome spécifique lorsque la bactérie se développe en mode biofilm. Parmi les protéines spécifiquement exprimées en mode biofilm, la protéine hypothétique PA3731 a été plus particulièrement étudiée. Cette protéine est impliquée dans la formation de biofilm, la production de rhamnolipides, la résistance à la tobramycine et la mobilité de type « swarming ». Des recherches bioinformatiques ont montré que le gène pA3731 appartient à un cluster de 4 gènes allant de pA3729 à pA3732 (système BAC), qui pourraient être impliqués dans l’élaboration et/ou la régulation d’un même système protéique. Cette hypothèse a constitué le point de départ de ce travail de thèse. La présente étude a permis de confirmer l’implication du système BAC dans la formation du biofilm, la résistance aux antibiotiques et la production de rhamnolipides chez PA. Les études protéomiques ont mis en évidence l’implication de ce système dans l’expression de la pompe MexEF-OprN, de la porine OprD, et dans la régulation du Quorum Sensing. Des études intéractomiques, menées en parallèle, ont montré une forte interaction entre la protéine PA3731 et PA3732. Ces études ont également permis de valider une forte interaction entre ces protéines et les rhamnolipides. L’ensemble de ces résultats nous permettent d’avancer une hypothèse quant à l’implication du système BAC dans le transport des rhamnolipides vers le milieu extracellulaire.   https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-02272748/document

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